近日,我院在顶级学术期刊《Nature Communications》上发表研究成果“A deep learning-based stripe self-correction method for stitched microscopic images”。该论文以福州大学为第一单位,我院黄峰研究员、计算机大数据学院刘文犀教授、福建师范大学陈建新教授为论文的共同通讯作者。我院王舒副研究员、计算机大数据学院硕士研究生刘晓翔、我院硕士研究生李越颖为该篇论文的共同第一作者。
光学显微成像技术是生命科学与基础医学领域的重要研究工具。然而,因成像系统稳定性或生物样本质量等多重不确定因素,拼接显微图像不可避免地会存在不同类型的条纹或伪影,严重影响图像质量和下游定量分析。
为有效解决此问题,该论文提出了一种基于深度学习的条纹自校正方法(Stripe Self-Correction method, SSCOR)。该方法提出了一种邻近采样方案和对抗性循环自训练范式,利用从拼接图像自身采样的无条纹图像块来校正其相邻的条纹图像块,在校正过程中无需任何成像参数估计或原始拼接信息即可复原真实图像。与现有方法相比,SSCOR已在多光子、受激拉曼、宽场荧光、H&E染色4种不同模态和成像条件的数据集上取得最佳性能,不仅可以自适应地校正非均匀、倾斜、网状条纹,还可以消除扫描、气泡和离焦伪影。该方法突破了国际商用显微图像条纹校正软件间的技术壁垒,为生物医学成像工作者提供了一种全新的图像复原解决方案,推动了智能显微成像技术的发展。
该研究受到了国家科技重点项目、国家自然科学基金、福建省自然科学基金等项目的资助,是研究院在生物医学成像研究领域中取得的重要突破。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-023-41165-1